Protein–RNA interactions for Protein: P97471

Smad4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad4P97471 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Smad4P97471 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad4P97471 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad4P97471 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Smad4P97471 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad4P97471 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Smad4P97471 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Smad4P97471 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Smad4P97471 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Smad4P97471 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad4P97471 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Smad4P97471 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms