Protein–RNA interactions for Protein: P80313

Cct7, T-complex protein 1 subunit eta, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct7P80313 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cct7P80313 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cct7P80313 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct7P80313 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cct7P80313 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cct7P80313 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cct7P80313 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cct7P80313 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cct7P80313 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cct7P80313 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct7P80313 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cct7P80313 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cct7P80313 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cct7P80313 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cct7P80313 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cct7P80313 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Cct7P80313 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Cct7P80313 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms