Protein–RNA interactions for Protein: P70663

Sparcl1, SPARC-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 650 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sparcl1P70663 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sparcl1P70663 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sparcl1P70663 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Sparcl1P70663 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Sparcl1P70663 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sparcl1P70663 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sparcl1P70663 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms