Protein–RNA interactions for Protein: P63143

Kcnab1, Voltage-gated potassium channel subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab1P63143 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Kcnab1P63143 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Kcnab1P63143 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnab1P63143 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnab1P63143 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Kcnab1P63143 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Kcnab1P63143 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Kcnab1P63143 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms