Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Strn4P58404 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Strn4P58404 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Strn4P58404 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strn4P58404 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Strn4P58404 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Strn4P58404 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Strn4P58404 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Strn4P58404 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Strn4P58404 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Strn4P58404 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
Strn4P58404 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Strn4P58404 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn4P58404 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Strn4P58404 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms