Protein–RNA interactions for Protein: P55849

Dsc1, Desmocollin-1, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsc1P55849 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dsc1P55849 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dsc1P55849 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Dsc1P55849 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Dsc1P55849 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Dsc1P55849 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms