Protein–RNA interactions for Protein: P54227

Stmn1, Stathmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmn1P54227 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Stmn1P54227 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Stmn1P54227 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Stmn1P54227 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stmn1P54227 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms