Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fdft1P53798 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fdft1P53798 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fdft1P53798 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms