Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PtpreP49446 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpreP49446 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PtpreP49446 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpreP49446 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpreP49446 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PtpreP49446 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PtpreP49446 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtpreP49446 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtpreP49446 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
PtpreP49446 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtpreP49446 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms