Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Rbp3P49194 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rbp3P49194 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rbp3P49194 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rbp3P49194 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rbp3P49194 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms