Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sdc2P43407 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sdc2P43407 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Sdc2P43407 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Sdc2P43407 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Sdc2P43407 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms