Protein–RNA interactions for Protein: P32020

Scp2, Non-specific lipid-transfer protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scp2P32020 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scp2P32020 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Scp2P32020 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Scp2P32020 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Scp2P32020 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scp2P32020 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Scp2P32020 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scp2P32020 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Scp2P32020 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Scp2P32020 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Scp2P32020 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Scp2P32020 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scp2P32020 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Scp2P32020 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 180.7 ms