Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Hoxc10P31257 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hoxc10P31257 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hoxc10P31257 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hoxc10P31257 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Hoxc10P31257 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms