Protein–RNA interactions for Protein: P27090

Tgfb2, Transforming growth factor beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb2P27090 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Tgfb2P27090 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Tgfb2P27090 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Tgfb2P27090 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tgfb2P27090 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Tgfb2P27090 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Tgfb2P27090 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms