Protein–RNA interactions for Protein: P24610

Pax3, Paired box protein Pax-3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax3P24610 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pax3P24610 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pax3P24610 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pax3P24610 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pax3P24610 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pax3P24610 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pax3P24610 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax3P24610 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pax3P24610 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pax3P24610 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms