Protein–RNA interactions for Protein: P23881

Tcea3, Transcription elongation factor A protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea3P23881 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcea3P23881 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcea3P23881 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tcea3P23881 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tcea3P23881 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tcea3P23881 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms