Protein–RNA interactions for Protein: P19137

Lama1, Laminin subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 3,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama1P19137 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lama1P19137 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lama1P19137 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Lama1P19137 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Lama1P19137 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Lama1P19137 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lama1P19137 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lama1P19137 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lama1P19137 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Lama1P19137 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lama1P19137 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Lama1P19137 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Lama1P19137 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama1P19137 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Lama1P19137 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Lama1P19137 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms