Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rps6ka3P18654 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka3P18654 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka3P18654 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps6ka3P18654 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms