Protein–RNA interactions for Protein: P14576

Srp54, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54P14576 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Srp54P14576 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Srp54P14576 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Srp54P14576 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54P14576 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54P14576 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54P14576 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Srp54P14576 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Srp54P14576 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp54P14576 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Srp54P14576 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms