Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Myod1P10085 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Myod1P10085 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Myod1P10085 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myod1P10085 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Myod1P10085 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Myod1P10085 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms