Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30,32■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Nid2O88322 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC30,28■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,27■■■□□ 2,44
Nid2O88322 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,24■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Nid2O88322 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,23■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC30,22■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC30,21■■■□□ 2,43
Nid2O88322 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC30,21■■■□□ 2,43
Nid2O88322 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30,2■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30,2■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC30,19■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC30,17■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,17■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC30,16■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC30,15■■■□□ 2,42
Nid2O88322 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Nid2O88322 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nid2O88322 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,13■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC30,12■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC30,11■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC30,1■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Nid2O88322 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC30,08■■■□□ 2,41
Nid2O88322 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,06■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Nid2O88322 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Nid2O88322 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Nid2O88322 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73,8 ms