Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trdmt1O55055 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trdmt1O55055 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trdmt1O55055 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Trdmt1O55055 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Trdmt1O55055 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
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