Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Bnc1O35914 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Bnc1O35914 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Bnc1O35914 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Bnc1O35914 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Bnc1O35914 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms