Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CltaO08585 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CltaO08585 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CltaO08585 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CltaO08585 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltaO08585 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltaO08585 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CltaO08585 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CltaO08585 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CltaO08585 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltaO08585 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CltaO08585 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CltaO08585 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CltaO08585 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CltaO08585 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CltaO08585 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltaO08585 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltaO08585 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CltaO08585 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltaO08585 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CltaO08585 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltaO08585 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltaO08585 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CltaO08585 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CltaO08585 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CltaO08585 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CltaO08585 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CltaO08585 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CltaO08585 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltaO08585 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltaO08585 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltaO08585 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CltaO08585 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CltaO08585 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CltaO08585 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltaO08585 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltaO08585 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CltaO08585 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CltaO08585 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltaO08585 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltaO08585 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CltaO08585 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltaO08585 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltaO08585 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CltaO08585 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CltaO08585 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CltaO08585 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CltaO08585 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltaO08585 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltaO08585 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltaO08585 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CltaO08585 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CltaO08585 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CltaO08585 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltaO08585 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltaO08585 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CltaO08585 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltaO08585 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CltaO08585 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CltaO08585 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltaO08585 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltaO08585 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
CltaO08585 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltaO08585 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CltaO08585 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms