Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20878L7N244 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm20878L7N244 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm20878L7N244 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Gm20878L7N244 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm20878L7N244 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm20878L7N244 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
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