Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Gm21887J3QQ04 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
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Gm21887J3QQ04 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 4930412E21Rik-201ENSMUST00000194267 778 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 4933403O08Rik-201ENSMUST00000132037 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm21887J3QQ04 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
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