Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC36,09■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC36,08■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,37
Abca16E9PWJ7 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,03■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,02■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,01■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36,01■■■■□ 3,36
Abca16E9PWJ7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC36■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC36■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC35,98■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC35,96■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,95■■■■□ 3,35
Abca16E9PWJ7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC35,94■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,94■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,91■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35,89■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,89■■■■□ 3,34
Abca16E9PWJ7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC35,88■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC35,86■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC35,85■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC35,85■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,84■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC35,83■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,33
Abca16E9PWJ7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC35,82■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,8■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,79■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC35,78■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC35,78■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,77■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC35,76■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Abca16E9PWJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Abca16E9PWJ7 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC35,75■■■■□ 3,31
Abca16E9PWJ7 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Abca16E9PWJ7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,75■■■■□ 3,31
Abca16E9PWJ7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36,3 ms