Protein–RNA interactions for Protein: D3YVI9

Trim30c, Tripartite motif-containing 30C, mousemouse

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30cD3YVI9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trim30cD3YVI9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trim30cD3YVI9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trim30cD3YVI9 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Trim30cD3YVI9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms