Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Rhbdl2A2AGA4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rhbdl2A2AGA4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rhbdl2A2AGA4 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rhbdl2A2AGA4 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms