Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Nlrp1bA1Z198 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nlrp1bA1Z198 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nlrp1bA1Z198 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms