Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15,72■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,71■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,71■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15,7■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15,69■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,69■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,68■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,67■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,66■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,65■□□□□ 0,1
Gm28269A0A087WSG3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,64■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,63■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC15,62■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15,61■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,6■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,59■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15,58■□□□□ 0,09
Gm28269A0A087WSG3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,58■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Gm28269A0A087WSG3 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15,56■□□□□ 0,08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,3 ms