Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PARP3Q9Y6F1 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PARP3Q9Y6F1 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms