Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DTX4Q9Y2E6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms