Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SNX12Q9UMY4 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SNX12Q9UMY4 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms