Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVR0

KLHL11, Kelch-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL11Q9NVR0 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KLHL11Q9NVR0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL11Q9NVR0 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
KLHL11Q9NVR0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms