Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HIRIP3Q9BW71 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
HIRIP3Q9BW71 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms