Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SIN3AQ96ST3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms