Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCDC85AQ96PX6 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms