Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TTLL11Q8NHH1 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TTLL11Q8NHH1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms