Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4V2

SVOP, Synaptic vesicle 2-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVOPQ8N4V2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SVOPQ8N4V2 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms