Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHCHD4Q8N4Q1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms