Protein–RNA interactions for Protein: Q86UN3

RTN4RL2, Reticulon-4 receptor-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4RL2Q86UN3 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RTN4RL2Q86UN3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RTN4RL2Q86UN3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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