Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
SMARCD3Q6STE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms