Protein–RNA interactions for Protein: Q60I27

ALS2CL, ALS2 C-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CLQ60I27 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ALS2CLQ60I27 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ALS2CLQ60I27 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms