Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CEP170Q5SW79 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CEP170Q5SW79 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms