Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUP188Q5SRE5 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUP188Q5SRE5 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms