Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
KLHL12Q53G59 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms