Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SP6Q3SY56 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SP6Q3SY56 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SP6Q3SY56 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SP6Q3SY56 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms