Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
ISXQ2M1V0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms