Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LAMA3Q16787 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
LAMA3Q16787 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
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